Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SPASTQ9UBP0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPASTQ9UBP0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPASTQ9UBP0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPASTQ9UBP0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPASTQ9UBP0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPASTQ9UBP0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPASTQ9UBP0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPASTQ9UBP0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPASTQ9UBP0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPASTQ9UBP0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPASTQ9UBP0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPASTQ9UBP0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPASTQ9UBP0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPASTQ9UBP0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPASTQ9UBP0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPASTQ9UBP0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms