Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN3Q9P1Z3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HCN3Q9P1Z3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms