Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNRD1Q9P1U0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNRD1Q9P1U0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms