Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms