Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MIS18AQ9NYP9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MIS18AQ9NYP9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MIS18AQ9NYP9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MIS18AQ9NYP9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MIS18AQ9NYP9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MIS18AQ9NYP9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MIS18AQ9NYP9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MIS18AQ9NYP9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MIS18AQ9NYP9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MIS18AQ9NYP9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MIS18AQ9NYP9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MIS18AQ9NYP9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MIS18AQ9NYP9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MIS18AQ9NYP9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MIS18AQ9NYP9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MIS18AQ9NYP9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MIS18AQ9NYP9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MIS18AQ9NYP9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MIS18AQ9NYP9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MIS18AQ9NYP9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MIS18AQ9NYP9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MIS18AQ9NYP9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MIS18AQ9NYP9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MIS18AQ9NYP9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MIS18AQ9NYP9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MIS18AQ9NYP9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MIS18AQ9NYP9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MIS18AQ9NYP9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MIS18AQ9NYP9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MIS18AQ9NYP9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms