Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK1

TLR7, Toll-like receptor 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,049 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR7Q9NYK1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TLR7Q9NYK1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TLR7Q9NYK1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TLR7Q9NYK1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TLR7Q9NYK1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TLR7Q9NYK1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TLR7Q9NYK1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TLR7Q9NYK1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TLR7Q9NYK1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TLR7Q9NYK1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TLR7Q9NYK1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLR7Q9NYK1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLR7Q9NYK1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLR7Q9NYK1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLR7Q9NYK1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLR7Q9NYK1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLR7Q9NYK1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms