Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HOXC10Q9NYD6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
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HOXC10Q9NYD6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXC10Q9NYD6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
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