Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT57Q9NWB7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
IFT57Q9NWB7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
IFT57Q9NWB7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
IFT57Q9NWB7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT57Q9NWB7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT57Q9NWB7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT57Q9NWB7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT57Q9NWB7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT57Q9NWB7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT57Q9NWB7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT57Q9NWB7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT57Q9NWB7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT57Q9NWB7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT57Q9NWB7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms