Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ASF1BQ9NVP2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASF1BQ9NVP2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms