Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RRP7BPQ9NSQ0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms