Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYLDQ9NQC7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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CYLDQ9NQC7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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CYLDQ9NQC7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYLDQ9NQC7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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