Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN4Q9NQC3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms