Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD8

UBE2T, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2TQ9NPD8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2TQ9NPD8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2TQ9NPD8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms