Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1LQ9HCJ6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms