Protein–RNA interactions for Protein: Q9H175

CSRNP2, Cysteine/serine-rich nuclear protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP2Q9H175 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSRNP2Q9H175 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms