Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL4Q9C0H6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL4Q9C0H6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL4Q9C0H6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL4Q9C0H6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL4Q9C0H6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL4Q9C0H6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL4Q9C0H6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL4Q9C0H6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL4Q9C0H6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL4Q9C0H6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL4Q9C0H6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL4Q9C0H6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL4Q9C0H6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL4Q9C0H6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL4Q9C0H6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL4Q9C0H6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL4Q9C0H6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL4Q9C0H6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms