Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP44Q9C0F1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CEP44Q9C0F1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms