Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IFIH1Q9BYX4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IFIH1Q9BYX4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms