Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NIFKQ9BYG3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms