Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VN1R3Q9BXE9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VN1R3Q9BXE9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms