Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
REPIN1Q9BWE0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
REPIN1Q9BWE0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms