Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTDSS2Q9BVG9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms