Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLF1Q9BQI6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLF1Q9BQI6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms