Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOL4Q9BPW4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms