Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRQ99707 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRQ99707 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRQ99707 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRQ99707 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRQ99707 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRQ99707 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRQ99707 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRQ99707 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRQ99707 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRQ99707 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRQ99707 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRQ99707 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRQ99707 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRQ99707 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRQ99707 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRQ99707 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRQ99707 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRQ99707 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRQ99707 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRQ99707 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRQ99707 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRQ99707 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRQ99707 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTRQ99707 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTRQ99707 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTRQ99707 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTRQ99707 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTRQ99707 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTRQ99707 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTRQ99707 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTRQ99707 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTRQ99707 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTRQ99707 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTRQ99707 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTRQ99707 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTRQ99707 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTRQ99707 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MTRQ99707 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTRQ99707 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTRQ99707 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTRQ99707 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTRQ99707 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTRQ99707 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTRQ99707 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MTRQ99707 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRQ99707 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRQ99707 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRQ99707 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRQ99707 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRQ99707 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRQ99707 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRQ99707 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRQ99707 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRQ99707 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRQ99707 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRQ99707 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRQ99707 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRQ99707 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRQ99707 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRQ99707 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRQ99707 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRQ99707 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRQ99707 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRQ99707 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRQ99707 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRQ99707 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTRQ99707 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTRQ99707 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTRQ99707 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTRQ99707 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTRQ99707 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MTRQ99707 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTRQ99707 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTRQ99707 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTRQ99707 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTRQ99707 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTRQ99707 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTRQ99707 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTRQ99707 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTRQ99707 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTRQ99707 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTRQ99707 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTRQ99707 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTRQ99707 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTRQ99707 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTRQ99707 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTRQ99707 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTRQ99707 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTRQ99707 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTRQ99707 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTRQ99707 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MTRQ99707 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTRQ99707 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTRQ99707 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTRQ99707 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTRQ99707 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTRQ99707 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTRQ99707 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTRQ99707 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms