Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POP1Q99575 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POP1Q99575 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POP1Q99575 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POP1Q99575 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POP1Q99575 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POP1Q99575 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POP1Q99575 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POP1Q99575 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POP1Q99575 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POP1Q99575 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POP1Q99575 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POP1Q99575 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POP1Q99575 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POP1Q99575 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POP1Q99575 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POP1Q99575 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POP1Q99575 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POP1Q99575 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POP1Q99575 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POP1Q99575 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POP1Q99575 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POP1Q99575 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POP1Q99575 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POP1Q99575 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POP1Q99575 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POP1Q99575 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POP1Q99575 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POP1Q99575 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POP1Q99575 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POP1Q99575 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POP1Q99575 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POP1Q99575 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POP1Q99575 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POP1Q99575 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POP1Q99575 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POP1Q99575 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POP1Q99575 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POP1Q99575 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
POP1Q99575 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POP1Q99575 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POP1Q99575 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POP1Q99575 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POP1Q99575 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POP1Q99575 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POP1Q99575 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POP1Q99575 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POP1Q99575 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POP1Q99575 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POP1Q99575 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POP1Q99575 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POP1Q99575 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POP1Q99575 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POP1Q99575 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POP1Q99575 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
POP1Q99575 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
POP1Q99575 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POP1Q99575 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POP1Q99575 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POP1Q99575 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POP1Q99575 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POP1Q99575 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POP1Q99575 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POP1Q99575 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POP1Q99575 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POP1Q99575 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POP1Q99575 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POP1Q99575 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POP1Q99575 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POP1Q99575 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POP1Q99575 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POP1Q99575 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POP1Q99575 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POP1Q99575 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POP1Q99575 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POP1Q99575 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POP1Q99575 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POP1Q99575 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POP1Q99575 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POP1Q99575 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POP1Q99575 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POP1Q99575 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POP1Q99575 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POP1Q99575 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POP1Q99575 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POP1Q99575 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POP1Q99575 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POP1Q99575 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POP1Q99575 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POP1Q99575 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POP1Q99575 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POP1Q99575 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POP1Q99575 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POP1Q99575 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POP1Q99575 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POP1Q99575 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POP1Q99575 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POP1Q99575 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POP1Q99575 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POP1Q99575 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms