Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
IFT140Q96RY7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
IFT140Q96RY7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms