Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ALS2Q96Q42 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms