Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms