Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SGF29Q96ES7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGF29Q96ES7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms