Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP9XQ93008 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP9XQ93008 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms