Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERCC4Q92889 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERCC4Q92889 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms