Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
PTPRUQ92729 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRUQ92729 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms