Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRIM41Q8WV44 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
TRIM41Q8WV44 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms