Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC12Q8WUD4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms