Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LMO3Q8TAP4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO3Q8TAP4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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