Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMIEQ8NEW7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMIEQ8NEW7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms