Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CSNK2A3Q8NEV1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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