Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEA6

GLIS3, Zinc finger protein GLIS3, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3Q8NEA6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLIS3Q8NEA6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLIS3Q8NEA6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms