Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC21AQ8NDW8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC21AQ8NDW8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms