Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RTL3Q8N8U3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTL3Q8N8U3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms