Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGSF1Q8N6C5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGSF1Q8N6C5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms