Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3L3

TXLNB, Beta-taxilin, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXLNBQ8N3L3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TXLNBQ8N3L3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms