Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD163Q86VB7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms