Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CATSPER4Q7RTX7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CATSPER4Q7RTX7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms