Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC80Q76M96 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC80Q76M96 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC80Q76M96 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC80Q76M96 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC80Q76M96 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC80Q76M96 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC80Q76M96 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC80Q76M96 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC80Q76M96 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC80Q76M96 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC80Q76M96 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC80Q76M96 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC80Q76M96 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC80Q76M96 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC80Q76M96 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC80Q76M96 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC80Q76M96 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms