Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMIM5Q71RC9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMIM5Q71RC9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms