Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
XIRP1Q702N8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
XIRP1Q702N8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms