Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VSTM1Q6UX27 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VSTM1Q6UX27 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms