Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATRAIDQ6UW56 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms